二者区别在于财务预算不同、资产用途不同、投资项目不同以及偿还资金来源不同。

1、财务预算不同：一般债券计入公共财务收入预算内，计入财务为红字；专项债券计入政府机构性基金预算，不用计入财务红字。

2、资产用途不同：一般债券是地方政府所发行的，目的是能够减少资金短缺或者处理临时资金的短缺；专项债券是为了建设某项实际项目所发行的债券。

3、投资项目不同：一般债券借贷负债参与政府部门营运资金，主要是针对没有收入的服务项目；专项债券主要是针对有一定利润的固定项目，无法用于其他地区，其他行业国家政策的引导。

4、偿还资金来源不同：一般债券的还款资产来源于财政总收入；专项债券的还款来源于项目完成之后的政府性基金或者专项收入。

一般债券和专项债券是什么？

一般债券是根据债券的一般偿本付息方式的债券，一般包括政府债券、金融债券和企业债券等。

专项债指的就是专项债券，它是地方债券的一种，目的是为筹集资金建设某项工程所发行的债券。